Отдел регуляции генетических процессов

Лаборатория геномики

Шлома Виктор Владимирович
Заведующий лабораторией

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Шлома Виктор Владимирович зав. лаб. кбн shlomaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лактионов Пётр Павлович снс кбн laktionovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Посух Ольга Витальевна нс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Максимов Даниил Александрович нс кбн viftatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Юрлова Анна Александровна мнс кбн annushatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Калашникова Дарья Андреевна мнс   tsunatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg     Антошина Полина Андреевна ст. лаб.-иссл.   poloniumatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Болдырева Лидия Валерьевна снс совм. кбн asdatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Романов Станислав Евгеньевич нс совм. кбн romanovatmcb [dot] nsc [dot] ru

Бывшие сотрудники:

Белякин Степан Николаевич, кбн
Синицын Иван Александрович
Скворцова Ксения Николаевна

Направления исследований: 
  • Механизм эпигенетического наследования модификаций гистонов в процессе репликации генома дрозофилы
     
  • Механизмы регуляции генов транскрипционными факторами, участвующими в дифференцировке клеток в развитии дрозофилы
     
  • Проект Лаборатории эпигенетики, созданной на Факультете естественных наук Новосибирского государственного университета совместно с Лабораторией геномики Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН "Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга"

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Молекулярный детектив
О влиянии невесомости на дрозофил

you_tube.jpg Неформальное общение с кбн СН Белякиным о лаборатории и о науке вообще
you_tube.jpg Выступление кбн ОВ Посух на Ночи научных историй 2018
you_tube.jpg Фантастический геномный импринтинг у насекомых. Публичная лекция кбн СН Белякина
you_tube.jpg Выступление Романова СЕ на семинаре “Лайфхаки генной инженерии” 

Публикации: 

  1. Medvedeva S, Achasova K, Boldyreva L, Ogienko A, Kozhevnikova E. The application of explants, crypts, and organoids as models in intestinal barrier research. Tissue Barriers, 2024, doi: 10.1080/21688370.2024.2423137

  2. Klimenko ES, Sukhareva KS, Vlasova YuA, Smolina NA, Fomicheva YuV, Knyazeva A, Muravyev AS, Sorokina MYu, Gavrilova LS, Boldyreva LV, Medvedeva SS, Sejersen T, Kostareva AA. Flnc expression impacts mitochondrial function, autophagy, and calcium handling in C2C12 cells. (doi: 10.1016/j.yexcr.2024.114174) Exp Cell Res 442(1): 114174, 2024

  3. Маслов ДЕ, Осипов ИД, Васиховская ВА, Забелина ДС, Мещеряков НИ, Карташов МЮ, Романов СЕ, Нетесов СВ. Респираторно-синцитиальный вирус: биология, генетическое разнообразие и перспективные средства борьбы. (doi: 10.17116/molgen20244201116) Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 42(1): 16‑24, 2024

  4. Karetnikov DI, Romanov SE, Baklaushev VP, Laktionov PP. Age prediction using DNA methylation heterogeneity metrics. (doi: 10.3390/ijms25094967) Int J Mol Sci 25(9): 4967, 2024

  5. Самойлова ЕМ, Иванова АА, Лактионов ПП, Кальсин ВА, Романов СЕ. Сиртуины в патогенетической терапии нейродегенеративных заболеваний. (doi: 10.17816/clinpract624496) Клиническая практика 15(1): 75-90, 2024

  6. Самойлова ЕМ, Романов СЕ, Чудакова ДА, Лактионов ПП. Роль сиртуинов в эпигенетической регуляции и контроле старения. (doi: 10.18699/vjgb-24-26) Вавиловский журнал генетики и селекции 28(2): 215-227, 2024

  7. Osipov YA, Posukh OV, Kalashnikova DA, Antoshina PA, Laktionov PP, Skrypnik PA, Belyakin SN, Singh PB. H3K9 and H4K20 methyltransferases are directly involved in the heterochromatinization of the paternal chromosomes in male Planococcus citri embryos. (doi: 10.1007/s00412-023-00809-3) Chromosoma 132(4): 317-328, 2023

  8. Romanov SE, Shloma VV, Maksimov DA, Koryakov DE. SetDB1 and Su(var)3-9 are essential for late stages of larval development of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s10577-023-09743-7) Chromosome Res 31: 35, 2023

  9. Kusliy MA, Yurlova AA, Neumestova AI, Vorobieva NV, Gutorova NV, Molodtseva AS, Trifonov VA, Popova KO, Polosmak NV, Molodin VI, Vasiliev SK, Semibratov VP, Iderkhangai T-O, Kovalev AA, Erdenebaatar D, Graphodatsky AS, Tishkin AA. Genetic history of the Altai breed horses: from ancient times to modernity. (doi: 10.3390/genes14081523) Genes 14(8): 1523, 2023

  10. Романов СЕ, Шлома ВВ, Коряков ДЕ, Белякин СН, Лактионов ПП. Инсуляторный белок Cp190 регулирует экспрессию генов дифференцировки сперматоцитов в клетках мужского зародышевого пути Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0026898423010147) Молекулярная биология 57(1): 109-123, 2023

  11. Романов СЕ, Лактионов ПП. Практическое применение массового параллельного репортерного анализа в биотехнологии и медицине. (doi: 10.17816/clinpract115063) Клиническая практика 13(4): 74-87, 2022

  12. Shevelyov YY, Ulianov SV, Gelfand MS, Belyakin SN, Razin SV. Dosage compensation in Drosophila: its canonical and non-canonical mechanisms. (doi: 10.3390/ijms231810976) Int J Mol Sci 23(18): 10976, 2022

  13. Belyakin SN, Maksimov DA, Pobedintseva MA, Laktionov PP, Voronova D. ASIP promoter variants predict the sesame coat color in Shiba Inu dogs. (doi: 10.3390/vetsci9050222) Vet Sci 9(5): 222, 2022

  14. Ilyin AA, Kononkova AD, Golova AV, Shloma VV, Olenkina OM, Nenasheva VV, Abramov YuA, Kotov AA, Maksimov DA, Laktionov PP, Pindyurin AV, Galitsyna AA, Ulianov SV, Khrameeva EE, Gelfand MS, Belyakin SN, Razin SV, Shevelyov YuY. Comparison of genome architecture at two stages of male germline cell differentiation in Drosophila. (doi: 10.1093/nar/gkac109) Nucleic Acids Res  50(6): 3203–3225, 2022

  15. Bryzgunova O, Bondar A, Ruzankin P, Laktionov Petr, Tarasenko A, Kurilshikov A, Epifanov R, Zaripov M, Kabilov M, Laktionov Pavel. Locus-specific methylation of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 genes with single molecule resolution in cell-free DNA from healthy donors and prostate tumor patients: application in diagnostics. (doi: 10.3390/cancers13246234) Cancers 13(24): 6234, 2021

  16. Романов СЕ, Калашникова ДА, Лактионов ПП. Методы высокопроизводительного репортерного анализа энхансеров. (doi: 10.18699/VJ21.038) Вавиловский журнал генетики и селекции 25(3): 344-355, 2021

  17. Kalashnikova DA, Maksimov DA, Romanov SE, Laktionov PP, Koryakov DE. SetDB1 and Su(var)3-9 play non-overlapping roles in somatic cell chromosomes of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1242/jcs.253096) J Cell Sci 134(2): jcs253096, 2021

  18. Gilbert M, ..., Belyakin S, Yurlova AA, ..., Cleaveland S. Distemper, extinction, and vaccination of the Amur tiger. (doi: 10.1073/pnas.2000153117) Proc Natl Acad Sci USA 117(50): 31954-31962, 2020

  19. Романов СЕ, Лактионов ПП. Получение направленных делеций в геноме Drosophila melanogaster с помощью системы CRISPR/Cas9. В кн. Методы редактирования генов и геномов (отв. ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ВВ Власов). Новосибирск: Издательство СО РАН, 2020, гл. 9, с. 133-148

  20. Singh PB, Belyakin SN, Laktionov PP. Biology and physics of heterochromatin-like domains/complexes. (doi: 10.3390/cells9081881) Cells 9(8): 1881, 2020

  21. Chernonosova VS, Laktionov Petr P, Murashov IS, Karpenko AA, Laktionov Pavel P. Comparative gene expression profiling of human primary endotheliocytes cultivated on polyurethane-based electrospun 3D matrices and natural decellularized vein. (doi: 10.1088/1748-605X/ab7d84) Biomed Mater 15(4): 045012, 2020

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0017 (122011900429-5) Регуляция генной активности и эпигенетической наследственности.

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Лактионов ПП, Романов СЕ, Самойлова ЕМ, Калашникова ДА, Осипов ЯО, Поливцев ДЕ, Максимов ДА, Баклаушев ВП. Роль сиртуинов в регуляции старения резидентных стволовых клеток. Материалы Всероссийской конференции с международным участием "Биохимия человека-2024", М: Е-ното, 2024, 448 с, ISBN 978-5-906023-40-7, с. 36

  2. Летягина АЕ, Пиндюрин АВ, Яринич ЛА, Болдырева ЛВ, Огиенко АА, Галимова ЮА, Андреева ЕН, Омелина ЕС. Разработка модели, способной предсказать уровень зрелой мРНК в культивируемых клетках млекопитающих на основе последовательности DSE терминатора транскрипции. Сборник тезисов Международного конгресса "VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы", Санкт-Петербург, 2024, с. 386

  3. Медведева СС, Ачасова КМ, Болдырева ЛВ, Огиенко АА, Кожевникова ЕН. Роль церамидов в развитии синдрома повышенной проницаемости кишечника. Сборник тезисов 27-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием “Биология - наука XXI века”. Пущино, 2024, c. 298

  4. Osipov YA, Kalashnikova DA, Samoilova EM, Antoshina PA, Sidelnikov LO, Laktionov PP. Searching for potential functional state markers of cultured cells. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". c. 34-35. Новосибирск, 2023

  5. Sidelnikov LO, Epifanov RU, Osipov YA, Shloma VV, Kalashnikova DA, Samoilova EM, Laktionov PP. Search for markers of replicative potential of LF1 cells using cytologic methods. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". c. 46-47. Новосибирск, 2023

  6. Антошина ПА, Лактионов ПП, Максимов ДА, Белякин СН. Роль комплекса dREAM в регуляции генов в сперматогенезе Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 59. Новосибирск, 2023

  7. Коряков ДЕ, Романов СЕ, Калашникова ДА, Максимов ДА, Шлома ВВ, Лактионов ПП. Гистон метилтрансферазы Su(var)3-9 и SetDB1 дрозофилы. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 127. Новосибирск, 2023

  8. Smelova A, Maksimov D, Posukh O, Singh P, Belyakin S. The role of heterochromatin proteins in imprinted paternal X chromosomes elimination in the development of Sciara coprophila. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 144-145 (P-01.4-26), 2021

  9. Morozova EE, Laktionov PP, Singh P. The effect of LMNB1 in replicative senescence of human fibroblasts. Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2020. с. 503-504. ISBN 978-5-4437-1114-0

  10. Antoshina PA, Maksimov DA, Laktionov PP, Romanov SE. The dREAM complex binding on chromosomes of male germline cells during Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 23

  11. Osipov YA, Kalashnikova DA, Posukh OV, Antoshina PA, Belyakin SN, Singh P. The role of heterochromatin factors in the paternal genome inactivation during the embryogenesis of Planococcus citri. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 26-27

  12. Romanov SE, Laktionov PP, Belyakin SN. The role of CP190 in genetic regulation of Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 30

  13. Skrypnik PA, Maksimov DA, Posukh OV, Shloma VV, Belyakin SN, Singh PB. Identification of the CE region in the de novo assembled genome of S. coprophila. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 33 

  14. Ильин АА, Шлома ВВ, Оленкина ОМ, Ненашева ВВ, Абрамов ЮА, Пиндюрин АВ, Максимов ДА, Лактионов ПП, Белякин СН, Шевелев ЮЯ. Анализ динамики связывания хромосом с ядерной ламиной в ходе сперматогенеза у дрозофилы. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 119-120

  15. Romanov SE, Posukh OV, Maksimov DA, Belyakin SN, Laktionov PP. In vivo DamID mapping uncovered dynamic CP190 chromatin binding landscape in course of Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 68-69

  16. Maksimov DA, Laktionov PP, Posukh OV, Belyakin SN, Koryakov DE. Genome-wide analysis of SU(VAR)3-9 distribution in chromosomes of Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 49

  17. Maksimov DA, Antoshina PA, Kalashnikova DA, Posukh OV, Belyakin SN. Doublesex protein is associated with gene activation in Drosophila males. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 48

  18. Laktionov PP, Maksimov DA, Romanov SE, Antoshina PA, Posukh OV, White-Cooper H, Koryakov DE, Belyakin SN. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 40

  19. Belyakin SN, Posukh OV, Maksimov DA, Laktionov PP, Koryakov DE. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 7

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Laktionov PP. The role of sirtuins in the regulation of aging of resident human stem cells. Международная конференция Хромосома 2023, 5-10 сентября 2023, Новосибирск

  2. Лактионов ПП. Применение высокопроизводительных методов исследования регуляторных элементов генома для оптимизации экспрессии трансгенов. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Носоибирск

  3. Belyakin SN. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Laktionov PP. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  5. Belyakin S. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  6. Белякин СН. Картирование хроматиновых белков без применения антител. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  7. Лактионов ПП. Поиск генетических маркеров настабильных атером. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  8. Laktionov PP. Genome-wide profiling of gene expression and transcription factors binding reveals new insights into the mechanisms of gene regulation during Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  9. Белякин СН. The role of Suppressor of Under-Replication protein in epigenetic control and replication of the repressed regions in Drosophila melanogaster genome. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  10. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  11. Laktionov PP. Transcription factors Cookie monster and Cannonball in regulation of gene expression during Drosophila melanogaster spermatogenesis. Drosophila Genetics and Genomics Course, 27 July – 4 August 2014, Cambridge, UK

  12. Belyakin SN. Putative mechanism of the SUUR protein action in late replicating regions of Drosophila genome. 11th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-29 June, 2013, Lecce, Italy

  13. Белякин СН. Регуляция репрессированных районов генома в развитии Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  14. Laktionov PP. Identification of transcriptional regulators for testis-specific gene clusters in Drosophila melanogaster. 16th European Workshop on Molecular and Cellular Endocrinology of the Testis, 8-12 May, 2010, La Biodola, Island of Elba, Italy

  15. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  16. Belyakin SN. Gene density profile reveals the landmarks of late replicated domains in Drosophila melanogaster genome. 9th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-30 May 2009, Gubbio, Italy

  17. Юрлова АА. Доменная консервативность быстро эволюционирующего гетерохроматинового белка SUUR дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  18. Белякин СН. Плотность генов в поздно реплицирующихся доменах генома Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

Международное сотрудничество: 

  • The European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany
    Геномный анализ (2002 - 2005)

  • Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2010)

  • University of Toronto, Canada
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2011 - 2013)

  • Cardiff University, UK
    Исследование семенник-специфичных генов (2011 - 2108)

  • University of Edinburgh, UK
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Charité – Universitätsmedizin Berlin, Germany
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Università degli Studi della Tuscia, Viterbo, Italy
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

Патенты: 

Антошина ПА, Романов СЕ, Калашникова ДА, Лактионов ПП. Способ выявления регуляторных элементов генома и генетическая конструкция для применения в указанном способе. Патент на изобретение №2822825. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 15.07.2024

Награды: 

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Белякин СН (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Белякин СН (2007)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Лактионов ПП (2019)
Посух ОВ (2019)

Памятный знак "За труд на благо города"

Шлома ВВ (2003)

 

1 декабря 2016 года проект Indicator.Ru и инициативная группа ученых представили рейтинг молодых исследователей-руководителей проектов, поддержанных грантами РФФИ. В первую сотню рейтинга вошел кбн Белякин СН

Отдел регуляции генетических процессов

Служебные ссылки